Минтранс РФ создал оперативный штаб по аварии "Невского экспресса", его возглавил министр транспорта Игорь Левитин. Оперативная группа во главе с замминистра Андреем Недосековым выехала на место аварии. В группу также входят глава Росжелдора Валерий Петраков и и.о. главы Ространсназдора Александр Касьянов. На место аварии также выехал и глава РЖД Якунин.
По последним данным количество пострадавших в крушении - от 16 до 130 человек, 10 из которых - погибли.